Tujuan Institut Pesantren Sunan Drajat (INSUD) Lamongan adalah :
- Menghasilkan lulusan yang beriman, bertaqwa, menguasai iptek, professional, kreatif, inovatif, bertanggung jawab dan mandiri menuju terwujudnya masyarakat yang unggul.
- Meningkatkan kegiatan penelitian sebagai landasan penyelenggaraan pendidikan dan mengembangkan IPTEK serta menghasilkan, mengamalkan, mengembangkan dan menyebarluaskan IPTEK dalam skala regional, nasional maupun internasional.
- Mewujudkan pengelolaan yang terencana, terorganisir, produktif, efektif, efisien dan terpercaya untuk menjamin keberlangsungan kegiatan Perguruan Tinggi.
- Mewujudkan civitas akademika yang mampu menjadi tauladan dalam kehidupan masyarakat.
- Menjalin kerjasama dengan pihak lain untuk mengembangkan pendidikan dan penelitian.
Untuk mencapai tujuan tersebut dipilih sasaran‑sasaran antara lain :
- Penyelenggaraan pendidikan dan pengajaran.
- Penyelenggaraan penelitian dalam rangka pengembangan kebudayaan khususnya ilmu pengetahuan, teknologi, pendidikan dan seni serta menggiatkan dan memperdalam penelitian ilmu agama Islam.
- Penyelenggaraan pengabdian masyarakat.
- Terselenggaranya pendidikan berkualitas sehingga dapat membekali mahasiswa dengan perangkat keilmuan dan keahlian untuk terjun di masyarakat guna mengimplementasikannya.
- Mengembangkan ilmu pengetahuan dan keterampilan pada semua lapisan civitas akademika melalui penelitian, pengembangan dan pengabdian kepada masyarakat.
- Mengadakan kerjasama, dengan berbagai pihak baik Pemerintah maupun swasta, kelembagaan maupun pendidikan yang dapat mendukung kualitas kinerja penyelenggara program studi.